使用R或Excel重叠graphics

我有以下matrix，我想绘制使用R（首选）或Excel重叠的graphics。

abc a 1 0.5 0.7 b 0.5 1 0.4 c 0.7 0.4 1 

例如，上表显示a和b具有50％重叠，而a和c具有70％。

Answer 1

如果你想重叠，那么你错过了一个数字 – 重叠所有三个： a ， b ， c 。

正如Aniko在评论中写的，你可以使用Venn图，例如R-forge的Vennerable 。

安装需要BioConductor的一些软件包：

 source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite(c("graph", "RBGL", "gtools", "xtable")) install.packages("Vennerable", repos="http://R-Forge.R-project.org") 

您可以准备好您的数据：

 require(Vennerable) x <- Venn( SetNames = c("a", "b", "c"), Weight = c(`100`=1, `010`=1, `001`=1, `110`=0.5, `101`=0.7, `011`=0.4, `111`=.5) # I made this up cause your question miss it ) 

和瞧：

 plot(x, doWeights=TRUE) 

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一些额外的解释。

Vennerable包的数据结构需要提供集合名称（在你的情况下为"a" ， "b" ， "c" ）和每个交集的频率/比例。 这个0/1名称标识子集： 1表示“在集合中”， 0表示“不在集合中”。 所以例如：

• 100表示a ，而不是b ，不在c ，
• 011表示不在a ，在b ，在c

所以111意味着在所有三个集合，这是你的matrix中缺less，它不能被添加在那里。 对于您的样本数据，当a和b有0.7重叠，b＆c有0.4时，意味着同时在三组中至less有0.1（或者我错过了对这个数字的解释）。 （注：我认为我高估了这个0.5，应该低于0.4）

您可以在创buildmatrix之前将您的数据准备到维恩图，例如：

 X <- list( a = c("One", "Two", "Three"), b = c("One", "Three", "Four", "Five", "Seven"), c = c("Three", "Five", "Eight", "Nine", "Ten") ) x <- Venn(X) x # A Venn object on 3 sets named # a,b,c # 000 100 010 110 001 101 011 111 # 0 1 2 1 3 0 1 1 plot(x, doWeights=TRUE)