打印数组后，不需要的空格。 我正在使用Perl
我写了一个脚本来parsinginput文本文件并输出三个新的文本文件。 input文件有一个标题行，这是三个输出文件中的每一个。 输出文件的每行获得每个input文件行的前三个条目，然后只获得input行中的一部分条目。 所有文件都是制表符分隔的。
我的问题是，我不断得到一个额外的白色空间在我的输出线的末尾。 在VIM中查看时，我可以在输出文件的行尾看到这个空格。 在Excel中查看时看不到这些额外的空格。
以前，使用我的脚本的早期版本，我可以看到我的行尾使用Excel的额外的空白，但只能通过使用“全选”function。 在excel中显示的数据是我的Perl脚本打印一个数组的结果，在那里我编码print $outfile "@array" 。 我在其他地方了解到，打字print "@array"导致了一种插入，在我的行中添加了白色空格。 这个插值产生的空白在excel中不是立即可见的，但是在使用“全选”来突出显示数据时可以看到。 所以，我从print $outfile "@array"更改了我的代码来print $outfile @array 。 此更改导致输出文件在每个输出行的末尾仍保留一个空白区域，在VIM中可见但在Excel中不可见的空白区域。 这是我卡住的地方。
以下是我的脚本。 第一部分只是打开并读取input文件。 然后声明一些数组。 接下来， for loop开始逐行parsinginput文件，并将适当的内容推送到适当的数组中。 replace是为一个数组实现的。 同样，所有文件都是制表符分隔的。 最后，数组被打印到三个outfiles，使用print $outfile @array和print $outfile "@array" 。
你看到这个问题吗？ 谢谢！
#!/usr/bin/perl use strict; use warnings; die "usage: [ imputed genotype.file ]\n" unless @ARGV == 1; my $imputed = $ARGV[ 0 ]; open ( my $FILE, "<$imputed" ); my @data = <$FILE>; my @ADD = (); my @DOM = (); my @IMP = (); for ( my $i = 1; $i < scalar @data; $i++ ) ### for each line data[i], and use $i = 1 to ### skip header, 0 to include it output { my $line = $data[ $i ]; chomp $line; my @entries = split( '\t', $data[ $i ] ); push( @ADD, "$entries[ 0 ]\t$entries[ 1 ]\t$entries[ 2 ]\t" ); push( @DOM, "$entries[ 0 ]\t$entries[ 1 ]\t$entries[ 2 ]\t" ); push( @IMP, "$entries[ 0 ]\t$entries[ 1 ]\t$entries[ 2 ]\t" ); for ( my $i = 3; $i < scalar @entries - 1 ; $i+=3 ) ### for each entry per line { push( @ADD, "$entries[ $i ]\t" ); push( @DOM, "$entries[ $i + 1 ]\t" ); if ( $entries[ $i + 2 ] eq 'NA' ) ### to replace any occuring "NA"s with blanks { $entries[ $i + 2 ] =~ s/NA//; } push( @IMP, "$entries[ $i + 2 ]\t" ); } push( @ADD, "\n" ); push( @DOM, "\n" ); push( @IMP, "\n" ); } ### for loop open my $Afile, ">$imputed" . "_ADD.txt" or die $!; print $Afile @ADD; close $Afile; open my $Dfile, ">$imputed" . "_DOM.txt" or die $!; print $Dfile @DOM; close $Dfile; open my $Ifile, ">$imputed" . "_IMP.txt" or die $!; print $Ifile @IMP; close $Ifile;
你在使用数组元素末尾的问题。 使用function
join( "\t", ...)
代替。
我的意思是，只要创build输出数组，然后使用
print join "\t", @output;
有没有经过检验的例子：
#!/usr/bin/perl use strict; use warnings; die "usage: [ imputed genotype.file ]\n" unless @ARGV == 1; open my $Afile, ">$imputed" . "_ADD.txt" or die $!; open my $Dfile, ">$imputed" . "_DOM.txt" or die $!; open my $Ifile, ">$imputed" . "_IMP.txt" or die $!; <>; #skip header while(<>){ chomp; my @entries = split( '\t', $_ ); my @ADD = (); my @DOM = (); my @IMP = (); push( @ADD, $entries[ 0 ], $entries[ 1 ], $entries[ 2 ]); push( @DOM, $entries[ 0 ], $entries[ 1 ], $entries[ 2 ]); push( @IMP, $entries[ 0 ], $entries[ 1 ], $entries[ 2 ]); for ( my $i = 3; $i < scalar @entries - 1 ; $i+=3 ) { ### for each entry per line push( @ADD, $entries[ $i ] ); push( @DOM, $entries[ $i + 1 ] ); $entries[ $i + 2 ] =~ s/^NA$//; push( @IMP, $entries[ $i + 2 ] ); } print $Afile join( "\t", @ADD) , "\n"; print $Dfile join( "\t", @DOM) , "\n"; print $Ifile join( "\t", @IMP) , "\n"; } ### for loop close $Afile; close $Dfile; close $Ifile;
push( @ADD, "$entries[ 0 ]\t$entries[ 1 ]\t$entries[ 2 ]\t" );
这些行总是在最后添加一个标签，这可能是你所看到的。 另外，考虑使用join和数组片，而不是string插值，如：
push( @ADD, join( "\t", @entries[0..2] ) );